El Consejo Directivo es el órgano de dirección del IEPA y es elegido cada dos años por la asamblea general de asociados. A continuación, los miembros del Consejo Directivo para el periodo 2022-2023:
Rosa Huayre Cochachin
Dir. de Asuntos Financieros
Historiadora y Antropóloga
rhuayre@iepa.org.pe
Johnatan Vega Slee
Dir. Asuntos Académicos
Historiador y Antropólogo
jvega@iepa.org.pe
Paulo Esteban Silva
Sub-Director General
Politólogo
esilva@iepa.org.pe
Anthony Medina Rivas Plata
Director General
Politólogo
amedina@iepa.org.pe