El Consejo Directivo es el órgano de dirección del IEPA y es elegido cada dos años por la asamblea general de asociados. A continuación, los miembros del Consejo Directivo para el periodo 2020-2022:
Luis Meléndez Guerrero
Director General
Antropólogo
lmelendez@iepa.org.pe
Fabrizio Gonzalo Ruiz Rufino
Subdirector General
Politólogo
fruiz@iepa.org.pe
Johnatan Vega Slee
Dir. Asuntos Académicos
Historiador
jvega@iepa.org.pe
Cristina Araujo Pisco
Dir. Asuntos Administrativos
Politóloga
caraujo@iepa.org.pe
Paulo Esteban Silva
Dir. de Cooperación Internacional
Estudiante de Ciencia Política
esilva@iepa.org.pe
Milagros del Carmen Napán Quispe
Dir. de Comunicaciones
Politóloga
mnapan@iepa.org.pe